U-CH1

  1. Informatie voor onderzoekers
  2. Ziektemodellen
  3. U-CH1

Algemene Kenmerken

Leeftijd: 56 jaar
Geslacht: Mannelijk
Oorsprong ziekte: Sacraal
Ziektestatus: Terugkerend
Voorafgaande bestraling: Ja
Voorafgaande systeemtherapie: Geen
Bron: Silke Bruderlein, Peter Moller
Universiteit van Ulm

Moleculaire kenmerken

Celmorfologie: Fysalifeer
TBXT expressie: Positief; 10x dat van U-CH2 met overexpressie maar geen amplificatie
TBXT lokalisatie: Nucleair
CD24 expressie: Positief; 13x dat van U-CH2
HLA Type: A2
Sequentiegegevens:

WGS-, Exoom- en Transcriptoomgegevens beschikbaar: ruwe sequentiegegevens in Cavatica (Chordoma Foundation Dataset) en samenvattende gegevens in PedcBioPortal. Neem contact op met researchteam@chordoma.org voor vragen.
SMARCB1 status: Wild-type
Validatieresultaten: Validatierapport

Groeiomstandigheden

Groeimedium: IMDM: RPMI-1640 (4:1) +10% FBS
Bevriesmedium: 70% compleet groeimedium aangevuld met een extra 20% foetaal runderserum en 10% DMSO
Kweekomstandigheden: Temperatuur: 37°C
Atmosfeer: lucht, 95%; kooldioxide (CO2), 5%
Instructies voor subcultuur: Celcultuur Procedures

Publicaties

Gekenmerkt door:
  • Scheil S, Brüderlein S, Liehr T, Starke H, Herms J et al. (2001) Genoomwijde analyse van zestien chordomen door middel van vergelijkende genoomhybridisatie en cytogenetica van de eerste menselijke chordoomcellijn, U-CH1. Genen Chromosomen Kanker 32: 203-211. PubMed: 11579460.

Aanvullende referenties:

  • Scheipl S, Lohberger B, Rinner B, Froehlich EV, Beham A et al. (2013) Histone deacetylase inhibitors as potential therapeutic approaches for chordoom: an immunohistochemical and functional analysis. J Orthop Res 31(12):1999-2005. PubMed: 23893747.
  • Brüderlein S, Sommer J, Meltzer P, Li S, Osada T et al. (2010) Molecular Characterization of Putative Chordoom Cell Lines. Sarcomen: 630129. PubMed: 21253487.
  • Duan Z, Shen J, Yang X, Yang P, Osaka E et al. (2014) Prognostische betekenis van miRNA-1 (miR-1) expressie in patiënten met chordoom. J Orthop Res. PubMed: 24501096.
  • Shalaby A, Presneau N, Ye H, Halai D, Berisha F, Idowu B et al. (2011) De rol van epidermale groeifactorreceptor in de pathogenese van chordomen: een potentieel therapeutisch doel. J Pathol 223(3):336-46. PubMed: 21171079.
  • Scheil-Bertram S, Kappler R, von Baer A, Hartwig E, Sarkar M et al. Molecular profiling of chordoom. Int J Oncol 44(4):1041-55. PubMed: 24452533.
  • Xia M, Huang R, Sakamuru S, Alcorta D, Cho MH et al. (2013) Identification of repurposed small molecule drugs for chordoom therapy. Cancer Biol Ther 14(7):638-47. PubMed: 23792643.
  • Duan Z, Choy E, Nielsen GP, Rosenberg A, Iafrate J et al. (2010) Differentiële expressie van microRNA (miRNA) in chordomen onthult een rol voor miRNA-1 in Met-expressie. J Orthop Res 28(6):746-52. PubMed: 20041488.
  • Yang C, Hornicek F, Wood KB, Schwab JH, Choy E et al. (2010) Karakterisering en analyse van menselijke chordoomcellijnen. Wervelkolom 35(13):1257-64. PubMed: 20461036.
  • Presneau N, Shalaby A, Ye H, Pillay N, Halai D, Idowu B et al. (2011) Rol van de transcriptiefactor T (brachyury) in de pathogenese van zelden voorkomende chordomen: een genetische en functioneel-gebaseerde studie. J Pathol 223(3):327-35. PubMed: 21171078.